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Sur cette page, j’essaie de garder une trace des ressources qui peuvent être utiles aux internes en psychiatrie. Dans chaque section, je fais de mon mieux pour ordonner par ordre d’importance.

Outils pratiques

• J’ai fait neurarium : ce qui a commencé comme un visualiseur 3D de neuroanatomie est devenu un atlas interactif du cerveau humain à sources notées, qui cartographie l’anatomie, le câblage, les récepteurs et les médicaments psychiatriques/récréatifs sur un même modèle rotatif et interrogeable. Vous pouvez écarter et éplucher l’anatomie, suivre les projections neuronales sous forme de flèches colorées selon le type (excitateur, inhibiteur, dopaminergique), et voir comment un médicament ou un récepteur donné illumine et anime les structures qu’il touche, chaque panneau de détail renvoyant vers les nœuds liés. Une seule recherche couvre à la fois les régions, les voies, les récepteurs et les médicaments, chaque vue est partageable via un lien direct, et chaque nœud porte une note de provenance indiquant la qualité de son sourçage. Il reste volontairement sans framework : JavaScript vanilla et three.js intégré localement, sans étape de build, données générées par des scripts Python, servi depuis un conteneur Caddy renforcé sur le plan de la sécurité avec une CSP stricte. Une instance publique est disponible sur neurarium.olicorne.org et le code source est sur GitHub.

  

• J’ai fait WebSend pour numériser des documents sans posséder de scanner à plat : un scanner de documents dans le navigateur, sans installation, qui permet de transférer instantanément des photos de votre smartphone vers n’importe quel ordinateur derrière un pare-feu. Ouvrez la page sur les deux appareils, scannez, c’est fait. Pas d’application, pas de cloud, aucune trace laissée. Sous le capot : chiffrement de bout en bout via WebRTC, traversée de pare-feux d’entreprise par STUN/TURN/TURNS, et recadrage intégré. Le serveur agit soit comme un simple relais de signalisation (sans jamais toucher vos données), soit, lorsque la connexion pair-à-pair directe est impossible, retransmet uniquement des blobs entièrement chiffrés qu’il ne peut pas lire. Les coûts de fonctionnement sont négligeables, il existe donc une instance publique gratuite sur websend.olicorne.org, et le code source est sur GitHub.

• J’ai également fait Parakeet Web pour transformer la parole en texte sur des machines où je n’ai pas le droit d’installer quoi que ce soit : transcription vocale directement dans le navigateur, avec un fort accent sur la confidentialité et la sécurité (aucune installation, aucune donnée envoyée à un serveur). Il fonctionne avec ma propre quantification SmoothQuant ONNX du modèle (discussion) et ma propre implémentation de boost de phrases (discussion). Je travaille sur un modèle médical amélioré et de meilleures fonctionnalités de dictée. Une instance publique est disponible sur parakeetweb.olicorne.org (pas de publicités, pas de pistage, pas d’installation, pas de comptes, entièrement gratuit et libre).

• J’ai fait justelesRCP pour consulter plus facilement des informations techniques sur les médicaments : un site statique rapide et sans publicité qui rend plus faciles à consulter les résumés des caractéristiques du produit (RCP) officiels français, les documents de référence validés par l’autorité de santé qui décrivent chaque médicament (indications, posologie, effets indésirables), principalement pour les professionnels de santé. Construit à partir des données ouvertes publiques de l’ANSM/BDPM, il couvre environ 15 600 médicaments, chacun sous forme de page précalculée avec recherche en langage naturel instantanée, gratuite et respectueuse de la vie privée, ainsi qu’une navigation de A à Z, sans publicité, sans compte, sans pistage, servi depuis un conteneur Caddy renforcé sur le plan de la sécurité et en lecture seule, hébergé en France. Une instance publique est disponible sur justelesrcp.olicorne.org et le code source est sur GitHub.

Interactions enzymatiques

• Semble plutôt complet et m’a été recommandé : ClinPGx (anciennement PharmGKB).
  • J’ai remarqué au moins une fois une simplification assez importante : le texte sur ClinPGx mentionnait un cytochrome comme étant le principal, alors que la source expliquait en fait que celui-ci était celui qui se liait le plus à la molécule mais comme il était moins présent, il n’était en fait pas le principal métaboliseur du médicament donné.
  • Ma conclusion est que la manière la plus fiable de vérifier les voies enzymatiques des médicaments est d’utiliser ClinPGx pour raisonner mais ensuite de lire tous les résumés des sources sous-jacentes pour réduire les chances que cela se reproduise.
• Initialement prometteur, semble citer les sources de manière systématique mais pas encore sûr de l’exhaustivité, 2021 initialement mais serait mis a jour 2 fois par an:
  • Mais: ne mentionne pas par exemple la lamotrigine, ou que une partie des interaction enzymatiques connue de la venlafaxine.
  • Drug Interaction Flockhart Table
    • https://drug-interactions.medicine.iu.edu/main-table
    • https://drug-interactions.medicine.iu.edu/search
• En français, de Suisse :
  • Bon tableau, m’a souvent été recommandé, 2017 : Interactions médicamenteuses, cytochromes P450 et P-glycoprotéine (Pgp)
  • Uniquement sur les antidépresseurs, 2013 : Dosage plasmatique des médicaments antidépresseurs
• Ce site web de recherche semblait contenir des outils prometteurs mais ils semblaient mal gérer leurs certificats HTTPS, 2020 :
  • https://insilico-cyp.charite.de/SuperCYPsPred/

Informations générales sur les médicaments

• ClinPGx (anciennement PharmGKB) (décrit ci-dessus).
• Le Résumé des Caractéristiques du Produit accessible via la Base de données publique du médicament.
• Vidal ainsi que Hoptimal Vidal (version « hôpital »).
• Pour savoir quels médicaments sont indisponibles aux patients : Disponibilité des produits de santé

Formules et Scores

• Calcul du QTc sur PsychoPharma.fr.